蒙医学将构成人体基本物质的食物精微(营养液)、血液、肌肉、脂肪、骨骼、骨髓、精液和使其时刻不断生化的精华称为七元，也称为七素。大便、小便和汗液等排泄物称为三秽。七元是依靠三根而存在的，七元与三秽的相互生化是人体进行新陈代谢的过程，蒙医称其为清浊分泌。从基础七元清浊分泌而生化出的津液称为正津。正津时刻在滋养着基础元气和补充三根，不断地进行着精华的吸收、糟粕的排泄运动。基础七元是构成人体各个器官的基本物质，正津又是反转使七元时刻生化的滋养液。

　　蒙医学认为，人体七素生化主要依靠三温(调火赫依、消化协日、腐熟巴达干)的作用下进行，即食物经过消化道时，在胃腑腐熟巴达干的作用下腐熟，消化协日的作用下熔化，调火赫依的作用下分化产生食物精微。元气生化过程总在饮食消化过程的基础上不断继续。而且在消化三温(主火温)的作用下进行高层次的、细微的、复杂的代谢，清浊分泌并且依次补充基础元气。食物精微清浊分泌，清通过输清管到肝脏，在变色协日的作用下成熟为血液；浊补充胃内的腐熟巴达干。血液在肝内清浊分泌，浊为胆汁，进入胆囊，再分泌为清浊，清成为黄水，浊进入肠道助消化，最后成为粪便之色素与尿之沉淀物；血液之清滋生肌肉的同时经心脏、血管在普行赫依的作用下营养全身。肌肉清浊分泌，清为脂肪，浊为眼眵、耳聍、鼻涕和唾液。脂肪之清滋养骨骼，浊为汗液和润滑物。骨之清为骨髓，浊为牙齿、指甲、毛发。骨髓之清为精液，浊为润肤之油腻物。精液蓄于“三舍”，其清则为身体之精华，即正津。这就是人体生理代谢过程。

　　蒙医学认为，食物精微是滋生其它元气的基础。精微滋生血液，血液输送清于全身，排泄浊于体外，是生命之支柱。肌肉是脏腑、软组织的主要构成物，并且在普行赫依的支配下完成身体的活动。脂肪保护着很多脏器，并且能使皮肤润软和具有弹性。骨骼是身体之支柱，使身体成形。骨髓贮藏营养，滋养体力。精液能使精神焕发，又是生殖之本。正津存在于心脏，遍布于全身，起到充实精神、气魄、延年益寿的作用。人体所产生的浊也是不可缺少的。食物浊补充腐熟巴达干，胆汁是消化协日的物质根源，眵、聍、涕对眼、耳、鼻有着保护作用，唾液有助消化作用，汗对皮肤起着保护、润肤等作用。七元生化过程相互之间有着密切的关系，如都正常进行则身体健康，任何一个环节发生问题则发生疾病。

　　蒙医学认为，人体的生命过程是一个综合的复杂活动过程，内部消化系统，外部言听视行，都不是孤立进行的，都是在三根七素的影响和支配下，人体脏之间、脏腑与体表之间的生命活动彼此协调，相互制约，才能维持人体内外环境的相对平衡，如某一部分发生病变，就会影响到其他部分以致整体，引起平衡失调，功能障碍，出现一系列病症。所以在诊断和治疗疾病过程中，不能只看表面现象，而要辩证地进行全身的综合分析才能得出正确的诊断。同时，蒙医学认为，人和自然界也是相互对立统一的，人体通过感受器官和外界自然环境保持着紧密联系，自然环境的变化必然对人体产生一定的影响。在正常情况下，通过人体内部三根的调节，使人体与自然环境的变化相适应。若三根与七素之间的平衡失调，相互为害，或由于某种外因，人体内外环境的相对平衡状态受到破坏，就会发生疾病。